民國六十九年七月三十一日，本院舉行第十四次院士會議之第二次會議時，楊忠道等廿一位院士聯名建議設立「統計學研究所」案，決議：「原則通過，照本院增設研究所之規定程序辦理。」復提報第十屆評議會第七次會議討論，決議：「原則同意，呈請先設籌備處。」，經總統府轉據行政院函復原則同意，並奉總統七十年二月十九日批：「准予照辦」，嗣經聘請周元燊院士等十三位先生為統計學研究所設所諮詢委員會委員，周院士為主任委員，趙民德博士為籌備處主任，積極展開籌備工作。

至民國七十六年八月，籌備處已粗具規模，奉准成所，同時將名稱改為現行之「統計科學研究所」，由趙民德博士任第一、二任所長（七十六年至八十二年），魏慶榮博士任第三、四任所長（八十二年至八十八年），並由林國棟博士(八十二年至八十七年)及周金鳳博士(八十七年至八十八年)任副所長。陳珍信博士於八十八年八月繼任所長，並由張源俊博士、陳素雲博士 (八十八年八月至八十九年八月二日)及趙晨慶博士(八十九年八月三日迄今)、黃顯貴博士（九十年七月十六日迄今）任副所長。