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| 1 | 院區大門 Main Entrance |
2 | 生物醫學科學研究所 Institute of Biomedical Sciences |
| 3 | 廢水處理場 Waste Water Treatment |
4 | 細胞與個體生物學研究所 Institute of Cellular and Organismic Bilolgy |
| 4 | 動物標本館 Exhibition Hall of Animal Specimen |
4 | 細胞與個體生物學研究所 Research Center for Biodiversity |
| 5 | 分子生物研究所 Institute of Molecular Biology |
6 | 生命化學研究所 Institute of Biological Chemistry |
| 6 | 生命科學圖書館 Life Science Library |
7 | 財團法人國家實驗研究院國家實驗動物中心 National Laboratory Animal Center |
| 8 | 幼稚園 Kindergarten |
9 | 溫室 Greenhouse |
| 10 | 家驊館 (總辦事處行正大樓) Administration Office and Computing Center |
11 | 臺灣史研究所 (Institute of Taiwan History, to be moved) |
| 11 | 動物標本館 Institute of animal sample |
11 | 植物標本館 Institute of Taiwan History |
| 12 | 植物暨微生物學研究所 Institute of plant and Microbial Bilolgy |
12 | 數學研究所 Institute of Mathematics |
| 14 | 蔡元培館 Tsai Yuan-Pei Memorial Hall |
14 | 調查研究專題中心 Center for Survey Research |
| 15 | 統計科學研究所 Institute of Statistical Sciences |
16 | 郵局、車庫及員工福利社 Post Office |
| 17 | 生態池 Ecological Pond |
18 | 基因體研究中心 Genomic Research Cente |
| 20 | 學術活動中心（四分溪書坊、大禮堂及中西餐廳） Center for Academic Activities (Book shop, restaurants and guest rooms) |
21 | 中國文哲研究所 Institute of Chinese Literature and Philosophy |
| 22 | 地球科學研究所 Institute of Earth Sciences |
23 | 綜合體育館 Gymnasium |
| 24 | 人文社會科學館 (人文館) Building for Humanities and Social Sciences |
24 | 人文社會科學聯合圖書館 (人文館1~2樓) Union Library for Humanities and Social Sciences (1-2 floors) |
| 24 | 應用科學研究中心 (人文館南棟11樓) Union Library for Humanities and Social Sciences (11th floor, South) |
24 | 環境變遷研究中心 (人文館南棟11樓) Research Center for Applied Sciences (11th floor, South) |
| 24 | 社會學研究所 (人文館南棟棟8~10樓) Institute of sociology (8-10th floors, South) |
24 | 語言學研究所 (人文館5~7樓) Institute of Linguistics (5-7th floor, South) |
| 24 | 臺灣史研究所 (人文館北棟7~8樓) Institute of Taiwan History (7-8th floors, North) |
24 | 政治學研究所籌備處 (人文館北棟5~6樓) Institute of Political Science, Preparatory Office (5-6th floor, North) |
| 24 | 法律學研究所籌備處 (人文館北棟 9~10樓) Institutum Iurisprudentiae (Institute of Law), Preparatory Office (9-10 floors, North) |
25 | 環境變遷研究中心 (實驗室) Research Center for Environmental Changes (Laboratory) |
| 30 | 化學研究所 Institute of Chemistry |
30 | 農業生物科技研究中心 Agriculture Biotechnology Research Center |
| 31 | 人文社會科學研究中心 Research Center for Humanities and Social Sciences |
32 | 資訊科學研究所 Institute of Information Science |
| 33 | 物理研究所 Institute of Physics |
33 | 應用科學研究中心 (實驗室) Research center for Applied Sciences (Laboratory) |
| 34 | 胡適紀念館 Hu Shih Memorial Hall |
35 | 近代史研究所 Institute of Modern History |
| 36 | 歐美研究所 Institute of European and American Studies |
37 | 歷史語言研究所 Institute of History and Philology |
| 37 | 歷史文物陳列館 Institute of Historical Relics |
38 | 傅斯年圖書館 Fu Ssu-Nien Library |
| 39 | 經濟研究所 Institute of Economics |
40 | 民族科學研究所 Institute of Ethnology |
| 41 | 嶺南美術館 (近美大樓) Lingnan Fine Arts Museum |
42 | 近史所檔案館 Archive Building, Institute of Modern History |
| 43 | 臺灣考古館 Museum of Taiwan Archaeology |
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